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Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具基本簡介
Graphpad Prism 是一款優秀的統計繪圖軟件,集生物統計、曲線擬合、科研繪圖于一體。軟件專門為科研工作者設計,可以輕松地進行統計分析并繪制統計圖,已被世界知名學府、科研機構、醫學中心和制藥企業廣泛使用。Graphpad Prism 具有功能實用、操作便捷等特點,自推出以來受到了很多用戶的喜愛,該軟件集生物統計、曲線擬合和科學繪圖于一體,可以幫助醫學人員輕輕松松就可以制作出專業的醫學表。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件科普
非線性回歸是分析數據的重要工具,但往往比需要的難度更大。 沒有其他程序能像 Prism 那樣簡化曲線擬合。 事實上,你通常可以在一個步驟中適合曲線。 只需從常用方程式的廣泛列表中選擇一個方程式(或輸入您自己的方程式),Prism 會自動完成其余部分 – 適合曲線,以表格形式顯示結果,在曲線圖上繪制曲線,并插入未知值。將多個數據集的數據并排放置在有組織的數據表上,而 Prism 可以一次將所有的數據集合在一起。 您可以分別將相同的模型擬合到每個數據集,使用全局非線性回歸在數據集之間共享參數值,或將不同的模型擬合到不同的數據集。
麻雀雖小五臟俱全,Prism 也為您提供了許多先進的配件選擇。它可以將最佳擬合參數的置信區間報告為非對稱范圍(P值相似方法),它比通常的對稱區間要精確得多。 它還可以自動插入標準曲線中的未知值(即分析RIA數據),使用F檢驗或Akaike信息準則(AIC)比較兩個方程的擬合,繪制殘差,識別異常值,差異重量數據點,測試正常性的殘差等等。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件功能
數據組織:
采用結構化、格式化的數據表概念,用戶需根據要創建的圖表或分析類型(如XY圖、柱狀圖、生存曲線等)選擇相應的數據表格式。
這種設計使得數據組織清晰,直接對應實驗的分組和重復設計,為后續統計分析和作圖打下堅實基礎。
統計分析:
內建豐富的統計分析方法,包括t檢驗、方差分析、非參數檢驗、線性回歸、邏輯回歸、生存分析等。
軟件能夠自動計算統計量、P值、置信區間等,并生成符合規范的統計結果表格和圖表。
引導用戶選擇合適的檢驗方法,避免誤用統計,并能自動解釋結果。
圖表繪制:
提供大量高度可定制的科研圖表模板,如柱狀圖、折線圖、散點圖、箱線圖、生存曲線圖等。
用戶可以自定義圖片的各個細節,如坐標軸、標題、圖例、刻度標簽等,以得到漂亮的統計圖。
支持多種格式的圖片輸出,包括高分辨率的TIF格式和EPS格式,滿足發表文章的各種需要。
結果整合與輸出:
項目文件包含所有數據表、分析結果、圖表和注釋,方便用戶進行項目管理和協作。
支持將多個圖表、結果表格、文本注釋組合排列在一頁或多頁上,形成完整的圖表結果展示頁。
可以導出單張或多張圖表為高分辨率圖片文件,或將整個布局導出為PDF。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具特色
直觀易用:
界面友好,無需編程基礎,降低學習門檻。
工具欄按鈕簡潔明了,一鍵式操作,包含了所有的繪圖和分析功能。
統計嚴謹:
內建豐富的統計分析方法,自動生成符合規范的統計結果。
在執行統計分析時,軟件會引導用戶選擇合適的檢驗方法,避免誤用統計。
圖表精美:
提供大量高度可定制的科研圖表模板,輸出出版級圖片。
用戶可以根據自己的需要選擇最適合的圖表類型,以展示數據的關系和趨勢。
數據與圖表聯動:
修改數據后,圖表會自動更新,避免重復勞動。
這種聯動性使得用戶可以更加高效地進行數據分析和可視化。
兼容性好:
支持Windows和Mac操作系統,滿足不同用戶的需求。
支持多種數據導出格式,方便與其他軟件(如Word、PPT)進行數據交互和協作。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具安裝步驟
1、在華軍軟件園下載這款軟件的壓縮包,解壓后,雙擊exe文件,進入安裝界面,點擊browse可以修改默認在C盤的安裝位置,建議大家選擇安裝在D盤,然后點擊install
2、軟件正在安裝,我們耐心等待
3、軟件安裝成功,點擊finish即可
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具使用方法
1、數據的錄入
打開GraphPad Prism軟件后,軟件會讓操作者選擇數據的輸入類型,此時注意選擇“Column”這個選項。如圖2所示:
之后分別輸入兩組變量的值。如圖3所示,實驗組共5個樣本,檢測數值分別為1,2,3,4和5;對照組也是5個樣本,分別是4,5,6,7和8。也可以在表頭上對數據進行標識,分別為Experiments和Controls。如果此處不進行標識,默認的組名是Dataset A和Dataset B。
2、結果的運算
結果錄入完畢后,點擊菜單欄中的Analyze,會出現如圖4所示的界面。注意左側一定要選中”t tests (and nonparametric tests)”。
點擊圖4中的OK,會進入如圖5所示界面。在此界面中,軟件要求作者選擇是否配對(Paired和Unpaired),并決定選擇參數檢驗還是非參數檢驗。所謂參數檢驗就是指配對t檢驗或獨立樣本t檢驗,而非參數檢驗則是指Mann-Whitney U檢驗或配對Wilcoxon檢驗。如果選擇參數檢驗(默認兩組數據均呈正態分布),軟件會讓操作者選擇方差是否齊。
如果方差齊,軟件會選擇t檢驗,如果不齊,軟件推薦Welch法。需要說明的一點是,如果兩組數據均呈正太分布,但方差不齊,此時應采用校正t檢驗,目前有三種主要的校正t檢驗法:Cochran & Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad Prism僅支持Welch法。
如果兩組數據不呈正太分布,則應該選用非參數檢驗。非參數的兩個選項分別是Mann-Whitney U檢驗和Kolmogorov-Smirnov檢驗。一般選擇Mann-Whitney U檢驗。
除了Experimental Design以外,還可以對Optional選項里面的內容進行修改。如圖6所示。一般建議選擇“Discreptive statistics for each data set”(展示各組數據的均數、中位數、標準差、秩和等)選項。在P value一段,系統默認為雙尾檢驗,一般建議不要更改。
所有的選項選擇完畢后,點擊OK即可進行計算。
3、結果的解讀
結果一般分為兩個部分,一是差異是否具有統計學意義;二是差異有多大。如果研究者選擇了Mann-Whitney U檢驗,則可得到如圖7所示的結果。
參數分析結果的解讀與此類似,只不過多了個F test to compare variances,即方差是否齊。一般認為,P值大于0.10才可以認為兩組數據方差相同(注意:是“大于”,不是“小于”!是“0.10”,不是“0.05”!!!!)。
4、檢驗數據是否呈正態分布
可能有的讀者會問GraphPad Prism能否判斷數據是否呈正態分布。其實是可以進行正態分布檢驗的。以上述兩組數據為例,首先點擊Analyze,然后選擇XY Analysis下面的Column statistics。如圖8所示:
如圖9所示,GraphPad Prism提供了三種檢驗數據是否呈正態分布的方法:D’Agootino-Pearson法,Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。針對同一種數據,三種方法的計算結果大同小異。雖然GraphPad Prism不推薦用Kolmogorov-Smirnov法,但根據筆者經驗,在國際上發表論文時,多采用Kolmogorov-Smirnov法的結果,可能是因為當樣本量太小時,Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法無法給出檢驗結果。當然,也可以三種方法都選擇,綜合判斷數據是否呈正態分布。
選擇好統計方法之后點擊OK,就可以得到正態檢驗的結果,如圖10所示。需要特別說明的是:在正態檢驗中,一般認為P大于0.10才表述數據呈正態分布(注意:是“大于”,不是“小于”!是0.10,不是“0.05”!!!!)。在本案例中,兩組數據的P值均為0.20,因此可以認為兩組數據均呈正態分布。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具常見問題
用Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版軟件繪制散點圖及線性分析?
打開Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版,將Y右側的第一欄選中,點擊create。
分別在X和Group A下方對應的空白處輸入組別,并在X、Y下方輸入數據。
點擊Graphs下方的Data1,輸出圖片,選擇散點圖,點擊ok。
點擊Analyze,點擊線性回歸(Linear regression)。
點擊ok,彈出如下對話框,繼續點擊Ok,出現擬合好的直線圖。
繼續點擊analyze,開始進行相關性分析。將線性回歸改成相關性(correlation)。
點擊Ok,彈出如下對話框,繼續點擊ok。在結果中可以看到散點圖的Pearson r 相關性以及P value大小。
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Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具更新日志
1:優化了性能
2:解決bug問題我們是認真的
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